全自動凝膠成像分析系統在生物實驗室和各類科研機構的應用也日益廣泛，已成各科實驗的重要輔助手段。通過對凝膠電泳后圖像的高效的捕捉與深入的分析，該系統已廣泛地在分子生物學、遺傳學、蛋白質組學等領域的基礎研究、臨床診斷以及藥物的研發等方面都得到了廣泛的應用，尤其在DNA、RNA和蛋白質的分離和定量的分析中具有十分重要的意義。
采用對其各主要的軟、硬件的整合和完善手段，全自動的凝膠成像分析系統的基本框構成由以下幾個主要的部分組成：
  1.成像設備：通過高精度的CCD或CMOS攝像頭的成像設備對凝膠中的熒光或顏色的信號的實時的動態的采集和將其高效的轉化為數字的圖像，對其的成像和分析具有了極大的方便性和靈活性。
  2.光源：根據所需的染料或標記的特異性，我們往往需要配備相應的波長的光源，如紫外燈或熒光燈等對其進行成像。
  3.凝膠槽：通過將電泳后的凝膠均勻的放置在專門的凝膠槽中，并配有恒溫的裝置，有效的避免了成像過程中對樣品的熱量的不良影響，從而更好的使得所得的圖像具有較高的清晰度和真實性。
 4.計算分析軟件：依托于對捕獲的圖像的深入的處理、分析和量化的計算分析軟件不僅能對帶狀和條帶的自動的識別，而且能對其所帶的信息的定量的分析。
  5.操作界面：基于優雅的操作界面不僅使得用戶能夠輕松地輸入所需的參數和參數的取值范圍，更為重要的是使得用戶能夠方便地啟動程序并快速地查看分析的結果。